Ну во-первых, смотря чем делать. Большинство загрузчиков еепром если и читают, то не пишут. А мимо там. Если в буте или МД флешером - можно и еепром перелить.
По существу: если иденты совпадают, можно одни калибры влить. Если не полностью - фулл, и все будет ок.
Калибры весят 32 кБ, лежат в фуле с адреса 0х8000h.
Eeprom тоже лежит в фуле, с адреса 0х4000h по 0х7FFFh. (Чтоб сделать вирджин - забить диапазон FF. Поставить блок, вкл. Зажигание на 30 сек, он и привяжется).
Ну и для полноты - в полном фуле с адреса 0х0h по 0х3FFFh лежит бутлоадер.
Ну вот, все секреты про ems3132 разболтал. Пользуйтесь...